玄武湖西傍石头城，东枕钟山，南依覆舟，北屏幕府，是个风水宝地，在湖中建造黄册库，再合适不过了，重新审视地形，庞煌不由赞叹朱元璋的眼光。
对于黄册存放在何处，朱元璋也花了不少心思。之所以最后定于玄武湖。是因为它水面阔大，湖内有数个岛屿。对于玄武湖优越的天然条件，盖玄武湖之广周遭四十里，中突数洲，断岸千尺，由是而库于其上，由是而册于其间，诚天造而地设也。其为图籍万年之计，殆无逾于此矣。
很明显，朱元璋认为后湖这样环水隔岸的条件，是用来建设档案馆最理想的环境。建库于湖中心，一方面可以防火，另一方面又可以保证安全。
朱元璋对自己给子孙后代留下的“祖制”是十分自信的。他认为经过自己这颗超级大脑十余年日夜不停的思考，这些“祖制”已经达到尽善尽美的程度，没有改进的余地了。一再强调，他留下的这些规矩，一个字也不许改。他嘱咐后代们“钦承联命，勿作聪明，乱我已成之法，一字不可改易”。他要求“以后嗣君，并不许立丞相，臣下敢有奏请设立者，文武群臣即时劾奏，处以重刑”。
黄册库初建时，只是在湖中的旧洲岛上建有少量库房。但是玄武湖中的册库与黄册，正在逐渐增多，已经提前规划好了旧洲、新洲、中洲等各岛。暂时用到的有册库三十四间黄册五万余本。在没有电脑的情况下，玄武湖成了现在世界上最伟大的档案馆之一。
朱元璋制定黄册制度的目的之一，是使富户多承担赋税。从而减轻贫困家庭的负担。所以他将普通百姓为分“三等九则”。关于上、中、下户等的划分，因各地情况不同而有所差别。
富户除了正常税赋外。还要承担协助政府收税等任务，贫户的负担则十分轻减。这些目的是好的。也想着长久的执行下去，所以经过考虑，让锦衣卫插手一部分其中的事务，达到威慑的目的。
到了现在，朱元璋依旧是不肯、也不能完全相信手下的官员，他相信的只是自己的亲兵和自己的亲属，