随着帅府军整训工作，各军的编制调整也随之完成。
中军编有步军十个指挥，马军一个指挥，加上直属的弩炮队、斥候队、辎重队和亲卫队，共有兵员八千余；前、左、右三军除步军各为六个指挥外，余者相同，各有兵员六千余；后军因为暂驻雷州，那里人口相对较多，经帅府同意后征募兵员两万多人，除一部分补充入琼州各军外，将后军扩充为步军十二个指挥，马军两个指挥，并辖有水军两个指挥，兵员过万，兵力超过中军成为各军之首。
水军经整编后设有白沙、澄迈、文昌三个水寨，其中白沙水寨编有大小战船四百艘，兵员有万，其余两寨各编有战船二百艘，各有兵五千余。但在赵昺看来此时的水军除了多了艄公、水手外与步军编制和训练方式没有多大不同，并非与战船为兵器，而不过是运输工具加海上平台。大家碰面先发弓弩，靠近后相互冲撞，挨上了就跳帮肉搏，以船为城展开攻防。如今战船上虽然加装了弩炮、火箭等远程投射武器，但更多也只是杀伤敌方船上的士兵，而不能完全达到以击沉、击毁对方战舰获得制海权的目的。
可明知如此，赵昺也没有更好的办法，因为冷兵器时代你不靠近大家相互够不着，威力也足以摧毁敌船，因而总不能靠嘴把对方骂走吧！摧锋军也是如此，还达不到单纯依靠武器和水手便能作战的水平，还需要大量的战兵参战，以致兵养了不少，但效率却不高。这样一来，水步军加上帅府直辖的摧锋军三千，马军一千及亲卫一个指挥，帅府军共有兵六万余……
谁都知道‘韩信点兵多多益善’的道理，但赵昺欣慰之余，小小年纪脑门上却多了条抬头纹，想着自己要不是还年轻头发都得白了，这无外乎还是钱闹的。想想六万大军人吃马喂一年仅粮食就得十几万石，薪饷一百多万贯，这还是平时的消耗。战事一起，还要加上武器的消耗，人员的赏赐、抚恤等等费用，费用翻两番都得念阿弥陀佛！
十月，按照大宋的税法正是征收秋税的时候，而秋税往往是农税的大头，可今年