在太常寺选定大婚和祭祀的日子后，礼部开始安排行程和开列陪祭的人员，刑部报备赦免名单，而兵部则负责安排行驾，户部预备所需，而工部则即刻遣人修缮途径道路和圆坛及太庙，仪仗照例由御前护军派遣。奏表很快送到了御前，由赵昺审阅。
赵昺已经想明白亲祭的意义，自然有了自己的主意。在大赦的问题上，他已经考虑过了，如今收复江南不到两年的时间，因而历史负担轻，且朝廷已经减免了许多苛捐杂税，免除了前朝拖欠的赋税，以利于休养生息。因而不存在缓和阶级矛盾的问题，宽赦面大为收窄。
不过赵昺在刑部报上的四赦名单中发现他们罗列了诸多进入江南后被惩处的叛官名字，且涉及蒙元官员，此外还有诸多刑事犯。惩治反叛和汉奸是他亲自下旨惩办的，这也是稳定江南的需要，再说许多人还参与了陈宜中及王真集团，是绝不能宽赦的。
于是赵昺紧急召见刑部尚书邓文原，令他重新开列赦免名单，并将时间段限制在景炎二年知祥兴六年，赦免在这期间获罪的官员及军兵，且将在历次战争中俘获的敌军官兵列入其中。也就是说此前服苦役的俘虏们可以与其他人一样领取薪资，不再是只管饭的苦逼了。而这涉及到整编的数个辎重师和新近组建的北方军团。
邓文原明白陛下这是画了条杠，以进入江南为界限，行朝琼州时期的在宽赦之列，而进入江南后的一律不再其列。显然是将那些获罪的江南旧官和士子们排出在外，让他们不得翻身，这不仅是惩罚也是一种警示。而他也清楚这是小皇帝彰显自己威信及打破当下沉闷和保守局面的信号，而这也是他们经历国破的士人对变革的愿望，他当然乐意助陛下完成。
然后赵昺又召见吏部尚书陈仲微和陈则翁，对于荫补之事进行商议。自然是取消了全面荫补的政策，而是仍将时间段划在了收复江南之前，为组建行朝和保护行朝立有大功的文武，但又含括了蒙元入侵江南后殉国的将士和臣僚。不过也是有限制的荫补，每户只限于一人，若想入仕为官则要