后来的发展正如马士英所预料的那样，到五月底，张献忠抵达武昌城下，开始攻城。当他来到城下时，城中官吏弃城而走，左良‘玉’带兵逃走，楚府军开城投降。
张献忠拿下武昌之后，实力大增，也雪李自成在武昌建立政权，自称西王，还开科取士，一经录取立即授予官职。
湖广局势如此不可收拾，任何人都没有办法。
这个时候的孙元和马士英已经回到了南京，湖广距离南京实在太远，他们作为南京地方守军，也不可能离开这里进入湖广参战，后勤根本就跟不上。
为了保障南京西面的安全，马士英将信守前诺，将庐凤军的‘精’锐‘交’给了黄得功，加强了他的力量，卸掉了庐凤总督一职，回到了南京兵部。
孙元也是感觉一阵奈加力，他现在什么也做不了，只能让部队陆续还镇，自己则留在南京述职。
不管怎么说，这次讨伐刘超在南京人看来获得了辉煌的战果，大军回南京，受到了百姓热烈的欢迎，就连一向看孙元不顺眼的史可法也亲自跑来军营褒奖有功将士。
这次大战，孙元本打算改变明末悲惨的局面，可结果却是白忙一场。可见，这历史的惯‘性’是何等的可怕，一只蝴蝶扇扇翅膀，并不足以引起一场大风暴。
下来之后，孙元想了想，突然有种明悟‘性’：“我就算打败李自成，解了开封之围又如何？河南已经残破成那样，这小冰河期不过去，年年大灾，朝廷根本就没有力量赈济百姓，安定地方，恢复生产。如此一来，不也盗贼遍地，李自成就算吃再多的败仗，只需要登高一呼，就又数之不尽的流民加入到他的造反大军之中。从某种意义上来说，李闯有数之不尽，用之不竭的人力、物力资源。而我军，这次出兵河南，一营所需都要依靠马士英筹措，等部队开到开封时，后勤线一拉长，部队供给就开始出问题了。所以，这一战，我却是根本没办法打的。”
“同样，湖广那边也是如此。打仗，说穿了打得就是钱。朝廷没钱，我没钱，