越过乌溪（注：即大肚溪），再北上大约四十华里，就离开了刘国轩从平埔番手中夺取的大肚王国故地。无论对于当初的荷兰统治者还是如今的明郑政权，这片土地都是陌生的荒原。不过随着实台移民的脚步，这片昔日的荒原已经充斥着大大小小的屯庄。
随着一个个新屯庄拔地而起，治所位于台南佳里兴的天兴州在管辖上便有些鞭长莫及了。为了健全地方单位、确保有效的通知，郑克臧提议，陈永华附议在天兴州以北设置一个新县。两人的报告呈到了思明，朱锦欣然命名为诸罗县，并任命部将陈可为知县。诸罗虽然只是“县”，但并不隶属于天兴州，依旧直接隶属于承天府，不过承天府此时也有名无实，因此实际上等于明郑中央直辖县。
成立新县虽然已经确定，但紧接着问题也来了。新县的县治设在哪里？根据朱锦赐予的县名，诸罗县的县城自然该设在诸罗山。“诸罗山”，系源自平埔族原住民洪雅族社名之译音，荷兰人称之为“tirosen”社。
诸罗山在早年就城为中国大陆大规模移民台湾之据点之一。明天启元年（1621年），原籍福建漳州的海盗颜思齐引率移民自笨港登陆，据以开垦拓荒。天启四年（1624年）荷兰人占据台湾，初期统治今之安平与台南市区一带，不久即安抚了诸罗山一带的平埔族，并对此地加以经营，风景幽美的红毛埤（今之兰潭水库），即是当时荷兰人所凿。
朱成功收复台湾之后，诸罗山一度位于天兴县（州）的最北境，按照朱锦赐名的用意显然是希望把这里作为新县的县治。朱锦这些选择自是考虑到当地殷服明郑政权已久，统治基础稳定，然而却跟郑克臧的想法有异。
“陈先生，余以为诸罗山可以从天兴州划出，但最为新县县治却过于偏南了，余以为，要更好的拓殖北路安抚司，新县的县治就尽可能的北移。”郑克臧的手指在一张极为简陋的台湾全图上指点着。“所以，余选这里。”
“龙目井？”看着郑克臧手指的，位于乌溪以北、大肚台地