朱成功时代由于戎马匆匆因此并没有建立一整套的内侍制度，而到了朱锦时代虽然设立了侍卫制度，但安平城内既有銮仪卫的亲随，又有郑克臧、郑克爽名下的护卫，更有数百名内侍和女官，再加上朱锦亲自掌握的内库及商船队，一切显得格外的纷杂无绪。正是鉴于这种杂乱的状态，郑克臧在剪除了冯锡范之后便决议彻底动个大手术，根据明廷内宫二十四衙门及清室内务府的体制对其做相应的调整。
二十四衙门是明代宦官体制，是宦官伺奉皇帝及其家族的机构，内设十二监，四司，八局。这十二监是司礼监，御马监，内官监，司设监，御用监，神宫监，尚膳监，尚宝监，印绶监，直殿监，尚衣监，都知监；四司是惜薪司，钟鼓司，宝钞司，混堂司；八局是兵仗局，银作局，浣衣局，巾帽局，针工局，内织染局，酒醋面局，司苑局。[bsp; 而内务府直属机构有广储、都虞、掌仪、会计、营造、慎刑、庆丰等七司及上驷院、武备院、奉宸苑等三院分别主管皇室财务、库贮、警卫扈从、山泽采捕、礼仪、皇庄租税、工程、刑罚、畜牧、御用马匹、制造与收储伞盖、鞍甲、刀枪弓矢等物、掌管各处苑囿的管理、修缮等事，此外内务府还有三织造处等30多个附属机构。
当然郑克臧这个时候不可能建立这么大的规模，因此他简单的将内廷分为了侍卫处、内侍处、女官处、经理处、内库房、内造局。
其中侍卫处主要承担对郑克臧、郑克爽、郑克举母子、董国太的警卫以及郑克臧的妻妾出行时的扈从；整个侍卫处共编制侍卫八十员，分侍卫、副侍卫及飞鱼服护卫、剑鱼服护卫四等，眼下侍卫一职由郑省英兼任，副侍卫虽然定员三人，但也只有孙有劳一人实任；侍卫处建立之后，銮仪卫就只承担安平城外堡防务及郑克臧出行时的外围护卫，不过侍卫处诸侍卫平日也不得擅入安平城内堡各院（苑），通常只是在银銮殿附近驻扎。
内侍处顾名思义是宦官组成的机构，不过鉴于明代宦官干政的苛烈，郑克臧只准备让他们承管安平