康熙二十六年三月十七日，康熙帝发布上谕对闽粤人事做了重新厘定，因为雷州泊地火灾而背负责任的李士桢被以为老迈昏聩为由免去巡抚及署理总督的职务随即致仕，其遗留两广总督一职由福建总督吴兴祚接任，广东巡抚一职由广西巡抚范承勋接掌，而两人的遗缺分别由江西巡抚王骘和直隶守道朱弘祚接任。
四月二十一日，吴兴祚自福州抵达广州与李士桢交接完毕，在送走了一脸萧瑟的李士桢之后，他立刻觉行了由拜音达礼、范承勋和侯袭爵以及新任广东陆师提督郎伊达参加的军事会议，老调重弹的决定了立刻收复琼州。然而侯袭爵坚持认为广东水师无力单独对抗郑军水师，要求吴兴祚出面约束葡萄牙人配合行动。吴兴祚当即答应了下来，一方面派人联络澳门，另一方面他向康熙上书要求撤换侯袭爵。
对于吴兴祚的上书，早就因为李士桢的报告而对侯袭爵心存不满的康熙第一时间予以批准。五月七日，上谕着侯袭爵以原品致仕，升福建海坛镇总兵官傅魁署理广东水师提督。同日，康熙还根据江苏和浙江两省的奏报设立江南苏松水师总兵官一职，任命江西袁州镇副将唐福出掌总兵官一职，希图以缓解舟山水师在东大洋、南大洋疲于奔命的局面。
但远在万里之外的北京城的决定已经送到了广州城，可近在咫尺的葡萄牙人却迟迟不给吴兴祚一个满意的答复，几番追问都以清军失约、如今船只已经出港等理由婉拒。由于时间已经临近风期，吴兴祚不愿久拖，于是重新祭出断绝贸易的法宝，然而澳门港外空空荡荡的，葡萄牙人也是有苦说不出，最终双方约定十月初重启掩护登陆的联合行动。
“制台大人，这或许是个好消息。”傅魁如此宽慰着焦虑异常的吴兴祚。“下官初来乍到，也却是要有些时日才能了解广东水师的事情，此外郎军门也是才从一等侍卫转任不久，各地客军也需要巡视安抚一番才好出战。”
吴兴祚用一种一场焦虑的语气说道：“就怕时日拖延，海逆已经搬空了琼州。”
吴兴祚