上元节才过，清军便在官长的驱使下向宁波扑来，在郑军无心抵抗之下，清军次第收复了宁波府城和镇海县城，名义上将郑军再次逐出了大陆。为了防止郑军再次闯入甬江及钱塘江，浙江巡抚张鹏翮力主在乍浦港和镇海建筑炮台。然而建炮台也好、铸炮也罢都需要钱，清廷财力本来已经极为困顿了，自然兵部是拿不出这笔开销的。
清史上号称清代第一清官、政声甚至好过大小于成龙的张鹏翮自然不会把来钱的目标放在老百姓头上，张鹏翮不但不把来钱的路数使在老百姓头上而且上疏北京声称绅民一亩地捐谷四合，实在盘剥过重，旋即又以杭州、嘉兴、绍兴、宁波等府兵祸之后秋收无存为由，请户部暂免缴纳第二年的赋税。
结果这两个折子到了北京，康熙一看自然心头不快，不过张鹏翮是为民请命，若是否决的话岂不是说自己是无道昏君吗？所以康熙在两个折子中寻了一个差错，批示道“昨岁浙江兵祸，循例蠲赋，并豁免钱粮，岂可强令捐输？鹏翮原题力不能者听，自相矛盾。”并籍此下部议，心领神会的吏部自然知道如此处置，于是张鹏翮就此贬为了兵部侍郎。
虽然清廷马上任命贵州布政使蒋寅接任浙江巡抚，但张鹏翮的去职还是使得浙省的军政出现了空白，不过郑军并没有利用这个机会重新踏足大陆，这倒不是郑军的消息闭塞，而是郑军正根据苏浙之战的战后总结进行整编。
苏浙一战的结果表明郑军的兵力不足以支撑大规模的战事，而且不但是总兵力不足，师团两级的建制尤小，在单独投入作战后不足以应对复杂的局面，为此郑军便迅速调整了现有的编制，将原来的团级编制扩大为八个哨。如此一来步哨的数目扩大一半，单个团的总兵力也有原来一千一百多扩大为一千五百余。除了团级建制扩大以外，师一级也增加了一个选锋哨和一个只配有少量战马的斥候哨。选锋哨与跳荡哨一样是重甲纯肉搏部队主要用来在混战中突破清军阵线、阻挡清军攻势；斥候哨接替骑军哨承担探查和传递情报的工作，骑军哨则整编为