随着吴兴祚等人一死一俘一逃，潮州之战已经到了尾声，自知以仅有的千数兵力无法对抗郑军反卷回来的浪头的潮州府选择了上吊自尽，剩下的清军在瞅见郑军严密的阵形后开城投降，法光寺一线的清军也在稍后散逃，至此郑军终于获得了潮州之战的最终胜利。
不过，郑军在广东的胜利并不能改变当前严峻的局势。
早在七月十三日，御驾亲征的康熙率直隶、山东、河南等地兵马并禁旅八旗前锋营、虎枪营、骁骑营等部五万人开抵江宁，虽然江南的炎热天气使得上述各部暂时无力继续进军，但随后从安徽、江西等地汇聚的部队使得屯驻在江南的清军兵力超过了八万，而更令明郑方面不安的是，布置在苏南浙北的近六万清军得以彻底脱出手来南下。
七月二十七日，次第南下的苏浙清军顶着台风抵达温台地区，除一部对太平一线的郑军实施封堵外，余部直趋鳌江，屯兵苍南。但是由于南雁荡层峦迭嶂崎岖难行的地貌，清军迟迟无法突破浙闽边境，只能不断的用血肉换取蔡元书部且战且退。
有鉴于直接进军福宁十分困难，清军被迫绕经道路同样难行的仙霞关一线，但是西线清军尚未入闽，引以为内应的福建邵武镇便被自福州西进的左右勇卫军所击破，南平、顺昌、邵武、建阳、浦城等地相继落入郑军手中。福建总兵毛洪言随即在闽西、闽西北大肆召集新兵，组建了左右邵武、左右南平等四个师。
清军也曾试着从赣南进军闽西，但是王新化率经过改编的两个师万余人自宁化越过武夷山攻入赣南石城，旋即克宁都州，守城宁都营全军覆没，此后王新化又在雩都击溃南赣镇总兵麾下吉安营、兴国营、文英营，永镇营，横冈营等部，兵逼赣州城下。
由于江西止有两镇绿营，其中九江镇大部已经东调江宁，剩下的又要震慑赣西防止义军死灰复燃，因此身兼江西水陆师提督的于成龙只能一方面亲赴抚州督战，另一方面向湖北、湖南两省请求援兵。不过湘省绿营中的镇溪营、河溪营、绥宁营、长安营、保靖