西汉设置护羌校尉，很重要的意图是为了防止羌人与匈奴互通声气。
但随着匈奴势力被西汉驱逐出河西，这项任务逐渐不再吃重了。
而针对羌人不相统属的情况，监视羌人的动向就是要阻止各个部落解仇交质，联合反叛。
一有风吹草动，就可以警备，防止塞内外羌人勾结寇乱。
到东汉汉羌关系矛盾激化时，护羌校尉越来越加重军事征伐的力度。
各任护羌校尉屡屡自领重兵，还指挥地方郡守、都尉配合征剿屠杀反抗的羌人。
西汉护羌校尉治所设置在令居塞，是陇西通往河西大道的屏障，重兵驻守。
而东边的陇道所在水草肥美，南北诸羌相互交通，也是要冲。
羌人为反抗汉朝统治，也往往切断陇道，使河西、河湟、陇右与关中联系困难。
《后汉书·西羌传》记载：“先零别种滇零与钟羌诸种大为寇掠，断陇道。……东犯赵、魏，南入益州，杀汉中太守董炳，遂寇钞三辅，断陇道。”
“号多退走，还断陇道，与零昌通谋。”
对于汉廷来说，要控制羌人还必须比较有效地控制陇道。
显然保护交通是护羌校尉的重要职责。
护羌校尉的屯田有独立的体制，受农都尉管理，直属中央大司农，但也受属地领导。
早在赵充国领军平羌之初，就注意到在金城屯田的便利。
屯田在控制、稳定边境的任务中能起到政治抚绥、军事征伐所不能起到的作用。
屯田可以保障军粮供应，减少运输的开支；可以牢牢控制住当地的经济命脉，达到排挤羌人牧场、压迫羌人生存空间、威胁镇摄羌人的功能。
所以在赵充国之后，邓训、侯霸、韩浩等边吏都重视在金城屯田。
屯田成为护羌校尉的一项职责。
也常调动指挥军队驻扎屯田，征发各郡屯田兵配合治羌征羌部署。
如和帝永元元年(89)，护羌校尉邓训