朱由校在端本宫坐稳太子位后，众大臣立刻群起上书要求李选侍从乾清宫搬出去，以便朱由校顺利继承大位。其中东林党的刘一燝、左光斗、杨链等重臣最为积极，态度强硬。东林的舆论力量再次挥了强大的作用，李选侍再想自持养母身份死皮赖脸呆在乾清宫不走的话，恐怕就会在东林舆论的诱导下，名声变成妖孽了。
李选侍无计可施，只得搬离了乾清宫，被朱由校下旨安排在宫妃养老的哕鸾宫。朱由校顺利继承皇位，昭告天下。他一入住大内，立刻依靠太监王安撤换了李选侍周围的一干人等，将李选侍困在冷清的哕鸾宫内。
于是朱由校外靠主持正统的朝廷大臣，内靠实权太监王安，坐上了龙椅，君临天下。摆在他面前的，虽然是个烂摊子，却同样让他兴奋不已。
大朝，在皇极殿，就是以前的奉天殿，进午门的第一个宫殿，隆重非常。文武百官齐齐向朱由校跪倒，高呼吾皇万岁万岁万万岁，声音洪亮、高亢、理直气壮。张问跪在靠后面的位置，也扯着嗓子高喊，他还是第一次参加这样隆重的大朝，心中激动万分，这里是天下的根本所在啊。
现在坐着龙塌上的那个少年朱由校，系着多少官员的身家和前途。他苍白的脸上浮出压抑不住的红晕，他坐的龙塌旁边，放着一个香炉，香炉上刻着大明山河图形。朱由校看着那图，仿佛自己的手里就攥着那山河一般，他的眼睛如此深情，比看任何人任何东西还要深情。
教坊司设中韶乐于殿内东西，锦衣卫设明扇于左右，一切都那么高调，那么正大光明、合乎礼乐之邦。朱由校轻轻咳了一下清清嗓子，朗声道：“众卿平身吧。”
众人又高唱：“谢吾皇万岁万万岁。”这时内侍太监拿表走到龙塌侧前，高唱颂词，各大臣又高唱准备好的歌功颂德文章，朱由校立刻变成了千古圣君。
朱由校饶有兴致地听完颂歌，说道：“众贤盈朝，论功行赏；论德定次，量能授官。”然后司礼监官员拿着祥云圣旨宣召，说完一个制曰，众人再次跪倒听宣。