朱由检对卢象升无疑是非常信任的，卢象升身为文官，又作战悍勇，令朱由检印象极为良好。
至于赵岩，在朱由检心中也有很不错的印象，此子虽是招抚而来，但杀贼却是无比积极，朱由检甚至没有下调令，他便赶赴中原击贼。
此前救下凤阳祖坟，此次又将闯王杀得大败亏输，这令朱由检心情十分不错，于是便同意了卢象升的建议，让卢象升将那四十万俘虏变民发往登莱屯垦。
不过陕西的糜烂，却让朱由检十分不喜。总督五省军务的洪承畴连陕西一隅之地也穷于应付，现在依旧有各部流贼窜于中原，更不是洪承畴力所能及。因此朱由检决定任命湖广巡抚卢象升总理直隶、河南、山东、四川、湖广等处军务，带领总兵赵岩所统登莱兵，祖宽、祖大乐、副将李重镇所统关辽兵和当地驻军夹剿，赐尚方剑便宜行事。明确地划分了职权范围：“洪承畴督剿西北，卢象升督剿东南。”
六月剿贼期限已过四月，除了中原战事略见好转外，西北却还是那般动乱，为了加快剿贼进度，朱由检又下了一道名为《大赦山陕胁从群盗》的诏书。
“朕仰承天道，俯御万方，念此军民，谁非赤子？止因官贪吏狡，年岁凶荒，以致饥寒所迫，甘作非为。一二无知，渐至胁从遂众。数年来无辜被僇，不知其几矣。朕痛心恻念，寝食靡宁……为此再颁赦书，遣官驰谕，所在抚按大书榜示，从俗开导。如有悔罪投诚，弃邪归正，即称救回难民，逐一查明籍贯，在本地者编入保甲，在各省者分遣护归，旧业清还，多方抚卹，若不愿归于本地，可往山东登莱屯垦，一律发给耕牛、田地，使安井里之乐，永消反侧之心。如有执迷不悟，怙终罔悛，彼既自外生成，岂得复容覆载？督、抚饬厉将士，合力夹剿，务尽绝根株，无滋余孽。呜呼，抚顺剿逆，朝廷法实无私；出死入生，若辈不可失算。诏布遐迩，咸使闻知。”
朱由检在诏书之中，也清晰的洞察了百姓从贼的核心原因，官员贪污[***]，加上灾荒不断，以至流贼做大。