开学后，因为是第一学年，大学本科的学生们不分专业，都上同样的课程：《工科数学分析基础》、《普通物理学》、《电子线路》、《化学原理》、《无线通信系统概述》。一方面固然是因为师资不足，另一方面这些都是学科基础课。另外还有一门英语课，因为每个人的水平参差不齐，因而分配在高等小学、初等中学等不同的班级里面上课。这时候薇拉、莉莉丝她们帮上了大忙。
而预科班的学生，类似于高等中学，需要在一年的时间里，把高中的所有课程补修完，通过考试，才能顺利进入本科阶段。当然，如果某门在入学的时候就达到免修，也可以直接旁听本科的课程。
授课采用双人制，一群人围着孙元起和另外一位西洋老师。比如《化学原理》课，先有耶鲁大学的一位博士用英语讲述一边，学生们手里拿着中文教材，努力去理解老师讲的是什么意思。本来已经预习一遍，学生们在听课的时候，一方面要解决自己不懂的疑问，一方面也是学英语。孙元起就是桥梁，只有在一方不明白，或者双方都不明白的时候才出面解答。
学校因为有三十个新学生的加入，明显热闹了许多，操场有了奔跑的人群，教室里有讨论的同学，几乎每个角落都有笑语或议论声。为了营造一个优美的环境，在比较静谧、优美的角落安有长椅，可以供学生们学习、休憩。
这些新来的学生，明显分为三派：一个是物理传习所的旧班底，因为中学就是崇实中学的校友，接受同样的教育，和孙元起的关系比较铁，很容易抱成一团。这些人除了本科、预科的，还包括高中里面的学弟，是势力最大的一派。他们多是接受西式教育，数理化发展平衡，素质比较优秀。另一个是胡勋、曾广锡、左功先、李国秉四个人的小团体，和孙元起也是熟识。他们更多的是接受传统教育，数理化中会有偏科，但上进心、好学程度却是极高的。最后一个，是其他的学生，不过有渐渐分化的迹象，根据个人情况，向前两派靠拢。
这在后来几届的经世大学中渐渐