?打入京都
寿永2年7月，从北陆道进入近江。占领了延历寺，将僧兵拉了过来；行家则进入大和国（奈良县）。摄津（大阪兵库一部分）源氏行纲本来是和平家一伙，此时也倒戈进入河内（大阪府）；足利义清也倒向。一时间，各方互相呼应，形成了直逼京都的态势。慌了神的平氏开会决定由平宗盛带上后白河法皇、安德天皇和三种神器向西海（中国、九州一带）逃跑。而后白河法皇却偷偷爬上了比睿山（镇护王城的灵山，天台宗总本山延历寺在此山上）。平宗盛只好匆匆放火烧掉豪邸，带上安德天皇和三种神器，狼狈不堪地逃往西海。后白河法皇在平氏撤离后又回到京都，热情地欢迎了大军进京，又立了后鸟羽天皇，由后白河法皇统揽大权，当然有一番论功行赏。奇怪的是，头功不是却是源赖朝。功劳第二，行家第三。被授从五位下左马头兼越后守；源行家被授从五位下备后（广岛县）守。然而，奖赏不公叫闷闷不乐，其实朝廷之所以要把头功给了源赖朝，正是为了牵制；另外还有个叫他不高兴的理由是，起兵本来是听命于不得志的以仁王，现在没有让以仁王继承皇位，他当然心有不甘。不过，由此也可看出，是个特别讲义气的人。
京都受挫
京都本不是大军呆的地方，首先筹措粮饷就是一大困难。一说征用，上至院宫下到平民一致反对。无可奈何之下只好默认部下兵勇抢劫。这样一来，勇武无敌解放者的英雄形象大打折扣；加之粗鲁的不讲礼仪——中纳言（官名）猫间光隆这样有身份的达官贵人来拜访，竟然将此调侃为“人猫对面”，管人家叫“猫阁下”，气得对方正事提都没提就悻悻而去了；乘坐牛拉花车（原平宗盛用的）本应从前面下车，但偏偏要从后面下车……结果，给京都人的印象是还不如平氏在京呢，他们迎来的是个野蛮人。这一来，其威望难免一落千丈。
为了让早日离开京都，后白河法皇一再命其前去打平氏。而等着源赖朝上京准备途中堵击，所以迟迟不动；而镰仓的源赖朝因担心奥羽方面的藤